Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PrcdQ00LT2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms