Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rbp4Q00724 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms