Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Bop1P97452 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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