Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
UbdP63072 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
UbdP63072 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
UbdP63072 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms