Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P58686 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P58686 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P58686 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
P58686 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P58686 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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P58686 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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P58686 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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P58686 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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P58686 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P58686 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P58686 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P58686 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P58686 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P58686 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P58686 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P58686 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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