Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NcstnP57716 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NcstnP57716 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms