Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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Gsc2P56916 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gsc2P56916 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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