Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn18P56857 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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