Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rab4aP56371 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Rab4aP56371 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab4aP56371 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab4aP56371 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab4aP56371 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab4aP56371 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab4aP56371 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab4aP56371 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab4aP56371 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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