Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Efnb1P52795 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Efnb1P52795 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Efnb1P52795 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Efnb1P52795 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Efnb1P52795 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Efnb1P52795 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Efnb1P52795 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Efnb1P52795 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Efnb1P52795 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Efnb1P52795 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Efnb1P52795 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Efnb1P52795 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms