Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa6P50704 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms