Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CtshP49935 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CtshP49935 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CtshP49935 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtshP49935 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtshP49935 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CtshP49935 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CtshP49935 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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