Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ercc3P49135 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms