Protein–RNA interactions for Protein: P48545

Kcnj5, G protein-activated inward rectifier potassium channel 4, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnj5P48545 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Kcnj5P48545 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Kcnj5P48545 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms