Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rfx1P48377 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rfx1P48377 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms