Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VdrP48281 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
VdrP48281 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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VdrP48281 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
VdrP48281 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
VdrP48281 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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