Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
NodalP43021 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
NodalP43021 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NodalP43021 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NodalP43021 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
NodalP43021 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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NodalP43021 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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NodalP43021 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NodalP43021 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NodalP43021 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NodalP43021 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NodalP43021 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NodalP43021 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NodalP43021 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NodalP43021 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NodalP43021 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NodalP43021 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms