Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx1-2P42580 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx1-2P42580 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms