Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tnfsf9P41274 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tnfsf9P41274 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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