Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LtbP41155 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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LtbP41155 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LtbP41155 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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LtbP41155 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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LtbP41155 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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LtbP41155 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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LtbP41155 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LtbP41155 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LtbP41155 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LtbP41155 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LtbP41155 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LtbP41155 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LtbP41155 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms