Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Rpl28P41105 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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