Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
VhlP40338 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
VhlP40338 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
VhlP40338 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VhlP40338 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms