Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Traf1P39428 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Traf1P39428 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms