Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lig1P37913 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms