Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Apoc3P33622 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms