Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nedd1P33215 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nedd1P33215 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd1P33215 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd1P33215 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd1P33215 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd1P33215 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd1P33215 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd1P33215 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd1P33215 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd1P33215 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nedd1P33215 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nedd1P33215 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nedd1P33215 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms