Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxc11P31313 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hoxc11P31313 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hoxc11P31313 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Hoxc11P31313 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxc11P31313 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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