Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc10P31257 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms