Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cd28P31041 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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