Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PrkcdP28867 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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