Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RxraP28700 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RxraP28700 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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