Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hoxd10P28359 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd10P28359 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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