Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CftrP26361 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CftrP26361 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CftrP26361 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CftrP26361 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CftrP26361 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CftrP26361 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CftrP26361 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CftrP26361 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CftrP26361 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CftrP26361 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CftrP26361 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CftrP26361 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms