Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Pou2f1P25425 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms