Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Pde6bP23440 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6bP23440 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6bP23440 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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