Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18530 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18530 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P18530 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18530 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18530 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P18530 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18530 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18530 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18530 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P18530 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms