Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim30aP15533 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms