Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RhoP15409 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RhoP15409 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RhoP15409 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RhoP15409 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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