Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lmnb1P14733 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lmnb1P14733 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms