Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cd5P13379 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms