Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl2P10148 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms