Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxa6P09092 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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