Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxd3P09027 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms