Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa7P02830 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxa7P02830 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms