Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01853 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01853 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01853 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01853 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01853 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P01853 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P01853 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01853 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms