Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ptpn20O55082 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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