Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Sdc4O35988 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sdc4O35988 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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