Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Pfdn4-202ENSMUST00000075087 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lhx8O35652 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Mup6-201ENSMUST00000107517 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Lhx8O35652 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lhx8O35652 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms