Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Cnih1O35372 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cnih1O35372 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms