Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq1O09165 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Casq1O09165 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq1O09165 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms